L'usine abandonnée revit. X.A.N.A en a investi tous les rouages. Dans le silence de la Cathédrale déserte, l'ordinateur fou attend nos amis. Tandis que Odd et Jérémie affrontent une salle des machines en folie, Yumi, Ulrich et Sissi sont pris au piège dans l'ascenseur dont la cabine s'écrase au sous-sol. Seule Yumi parvient à s'extraire des débris pour rejoindre Odd et Jérémie, prêts à intervenir sur Lyokô. Sissi et Ulrich sont prisonniers au fond du puit que l'eau envahit rapidement...